Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RPE65Q16518 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.9 ms