Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 CCNE2-202ENST00000396133 1361 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC2.03□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AC090970.1-201ENST00000561207 381 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HMGN3Q15651 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
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