Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
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PTPRKQ15262 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
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PTPRKQ15262 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
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PTPRKQ15262 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
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PTPRKQ15262 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
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PTPRKQ15262 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
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