Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
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