Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.1 ms