Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
DSC3Q14574 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms