Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.5 ms