Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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