Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRIM28Q13263 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
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