Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NME3Q13232 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
NME3Q13232 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
NME3Q13232 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
NME3Q13232 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
NME3Q13232 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NME3Q13232 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NME3Q13232 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NME3Q13232 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NME3Q13232 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NME3Q13232 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NME3Q13232 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NME3Q13232 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NME3Q13232 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NME3Q13232 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NME3Q13232 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NME3Q13232 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NME3Q13232 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NME3Q13232 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NME3Q13232 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NME3Q13232 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NME3Q13232 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NME3Q13232 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NME3Q13232 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NME3Q13232 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NME3Q13232 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NME3Q13232 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NME3Q13232 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NME3Q13232 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NME3Q13232 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NME3Q13232 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NME3Q13232 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NME3Q13232 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NME3Q13232 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NME3Q13232 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NME3Q13232 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NME3Q13232 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
NME3Q13232 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
NME3Q13232 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NME3Q13232 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
NME3Q13232 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
NME3Q13232 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NME3Q13232 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
NME3Q13232 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NME3Q13232 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NME3Q13232 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
NME3Q13232 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NME3Q13232 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NME3Q13232 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NME3Q13232 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
NME3Q13232 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NME3Q13232 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NME3Q13232 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NME3Q13232 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NME3Q13232 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NME3Q13232 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NME3Q13232 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NME3Q13232 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NME3Q13232 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NME3Q13232 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NME3Q13232 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NME3Q13232 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NME3Q13232 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NME3Q13232 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NME3Q13232 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms