Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
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CALCOCO2Q13137 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
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CALCOCO2Q13137 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
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