Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
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TRAF1Q13077 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
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TRAF1Q13077 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.73
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TRAF1Q13077 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
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TRAF1Q13077 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
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TRAF1Q13077 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
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TRAF1Q13077 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
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TRAF1Q13077 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
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TRAF1Q13077 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
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