Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 DPYD-202ENST00000370192 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 VWA5A-203ENST00000392748 3419 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 SLF2-202ENST00000370269 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 LINC00598-211ENST00000636621 3241 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 DOCK9-203ENST00000376460 7549 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AC010328.1-201ENST00000596769 4060 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AL357568.1-201ENST00000421530 1963 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 ZNF227-213ENST00000621083 3055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 SYT4-201ENST00000255224 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 B3GALT5-203ENST00000380620 13170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 PMFBP1-201ENST00000237353 3527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 GCNA-201ENST00000373695 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 INTS12-202ENST00000394735 1927 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 KCNIP4-201ENST00000359001 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 LCP1-201ENST00000323076 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
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