Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
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GTF3C1Q12789 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
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GTF3C1Q12789 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
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GTF3C1Q12789 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
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GTF3C1Q12789 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
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GTF3C1Q12789 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
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GTF3C1Q12789 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
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GTF3C1Q12789 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
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GTF3C1Q12789 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
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GTF3C1Q12789 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
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GTF3C1Q12789 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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