Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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