Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOSBP53539 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOSBP53539 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOSBP53539 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOSBP53539 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOSBP53539 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOSBP53539 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOSBP53539 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOSBP53539 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOSBP53539 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOSBP53539 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOSBP53539 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOSBP53539 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOSBP53539 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOSBP53539 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOSBP53539 AL139352.1-201ENST00000255183 1001 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOSBP53539 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOSBP53539 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOSBP53539 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOSBP53539 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOSBP53539 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOSBP53539 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOSBP53539 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOSBP53539 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOSBP53539 ALDH7A1P4-201ENST00000412255 178 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOSBP53539 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOSBP53539 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOSBP53539 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOSBP53539 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOSBP53539 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOSBP53539 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOSBP53539 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOSBP53539 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOSBP53539 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOSBP53539 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOSBP53539 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOSBP53539 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOSBP53539 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOSBP53539 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOSBP53539 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOSBP53539 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOSBP53539 SNORA74.1-201ENST00000516320 180 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOSBP53539 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOSBP53539 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOSBP53539 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOSBP53539 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOSBP53539 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOSBP53539 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOSBP53539 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOSBP53539 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOSBP53539 AL162377.2-201ENST00000624532 337 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOSBP53539 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOSBP53539 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOSBP53539 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOSBP53539 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOSBP53539 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOSBP53539 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOSBP53539 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOSBP53539 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOSBP53539 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
FOSBP53539 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
FOSBP53539 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
FOSBP53539 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
FOSBP53539 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
FOSBP53539 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
FOSBP53539 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
FOSBP53539 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
FOSBP53539 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
FOSBP53539 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
FOSBP53539 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
FOSBP53539 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
FOSBP53539 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
FOSBP53539 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
FOSBP53539 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
FOSBP53539 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
FOSBP53539 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
FOSBP53539 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
FOSBP53539 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
FOSBP53539 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
FOSBP53539 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
FOSBP53539 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
FOSBP53539 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
FOSBP53539 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
FOSBP53539 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
FOSBP53539 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
FOSBP53539 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
FOSBP53539 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
FOSBP53539 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
FOSBP53539 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
FOSBP53539 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
FOSBP53539 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
FOSBP53539 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
FOSBP53539 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
FOSBP53539 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
FOSBP53539 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
FOSBP53539 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
FOSBP53539 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
FOSBP53539 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
FOSBP53539 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
FOSBP53539 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97 ms