Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 EPGN-201ENST00000332112 847 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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