Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
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TRAF7Q6Q0C0 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TRAF7Q6Q0C0 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TRAF7Q6Q0C0 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TRAF7Q6Q0C0 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TRAF7Q6Q0C0 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
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TRAF7Q6Q0C0 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TRAF7Q6Q0C0 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
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TRAF7Q6Q0C0 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
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TRAF7Q6Q0C0 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
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TRAF7Q6Q0C0 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
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TRAF7Q6Q0C0 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
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TRAF7Q6Q0C0 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
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TRAF7Q6Q0C0 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
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TRAF7Q6Q0C0 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
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TRAF7Q6Q0C0 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
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TRAF7Q6Q0C0 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TRAF7Q6Q0C0 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TRAF7Q6Q0C0 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TRAF7Q6Q0C0 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TRAF7Q6Q0C0 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TRAF7Q6Q0C0 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
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