Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
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