Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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HIF1AQ16665 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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HIF1AQ16665 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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HIF1AQ16665 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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HIF1AQ16665 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
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