Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
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ZNF239Q16600 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
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ZNF239Q16600 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
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