Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AL138693.1-201ENST00000622219 129 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 C5orf24-201ENST00000338051 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AL031846.1-202ENST00000424436 592 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 SNORA74.1-201ENST00000516320 180 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 GAPVD1-202ENST00000297933 6003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AC099670.1-201ENST00000455141 783 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 MUC1-221ENST00000610359 1101 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 MUC1-227ENST00000615517 951 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms