Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
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SCN9AQ15858 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
SCN9AQ15858 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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SCN9AQ15858 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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SCN9AQ15858 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
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SCN9AQ15858 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
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SCN9AQ15858 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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SCN9AQ15858 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
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SCN9AQ15858 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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SCN9AQ15858 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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SCN9AQ15858 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCN9AQ15858 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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