Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USF2Q15853 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USF2Q15853 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USF2Q15853 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USF2Q15853 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USF2Q15853 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
USF2Q15853 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USF2Q15853 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USF2Q15853 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USF2Q15853 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USF2Q15853 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USF2Q15853 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USF2Q15853 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USF2Q15853 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USF2Q15853 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USF2Q15853 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USF2Q15853 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
USF2Q15853 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
USF2Q15853 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
USF2Q15853 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
USF2Q15853 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
USF2Q15853 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
USF2Q15853 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
USF2Q15853 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USF2Q15853 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USF2Q15853 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USF2Q15853 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
USF2Q15853 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
USF2Q15853 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
USF2Q15853 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
USF2Q15853 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USF2Q15853 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USF2Q15853 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USF2Q15853 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
USF2Q15853 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
USF2Q15853 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USF2Q15853 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
USF2Q15853 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USF2Q15853 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USF2Q15853 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USF2Q15853 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USF2Q15853 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USF2Q15853 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USF2Q15853 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
USF2Q15853 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
USF2Q15853 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USF2Q15853 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USF2Q15853 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
USF2Q15853 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
USF2Q15853 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
USF2Q15853 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
USF2Q15853 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USF2Q15853 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
USF2Q15853 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USF2Q15853 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
USF2Q15853 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
USF2Q15853 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.8 ms