Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AC009303.3-201ENST00000591103 736 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 RNU6-167P-201ENST00000384292 106 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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