Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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VAMP3Q15836 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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VAMP3Q15836 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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VAMP3Q15836 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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VAMP3Q15836 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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VAMP3Q15836 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
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VAMP3Q15836 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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VAMP3Q15836 AL355922.5-201ENST00000553534 351 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
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VAMP3Q15836 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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VAMP3Q15836 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
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VAMP3Q15836 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
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VAMP3Q15836 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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VAMP3Q15836 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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