Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHRNA6Q15825 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHRNA6Q15825 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHRNA6Q15825 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHRNA6Q15825 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHRNA6Q15825 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHRNA6Q15825 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHRNA6Q15825 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHRNA6Q15825 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHRNA6Q15825 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHRNA6Q15825 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHRNA6Q15825 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHRNA6Q15825 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHRNA6Q15825 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHRNA6Q15825 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHRNA6Q15825 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHRNA6Q15825 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHRNA6Q15825 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHRNA6Q15825 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHRNA6Q15825 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHRNA6Q15825 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHRNA6Q15825 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHRNA6Q15825 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHRNA6Q15825 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHRNA6Q15825 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHRNA6Q15825 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHRNA6Q15825 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHRNA6Q15825 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHRNA6Q15825 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHRNA6Q15825 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHRNA6Q15825 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHRNA6Q15825 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHRNA6Q15825 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CHRNA6Q15825 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CHRNA6Q15825 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHRNA6Q15825 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHRNA6Q15825 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHRNA6Q15825 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CHRNA6Q15825 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHRNA6Q15825 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHRNA6Q15825 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CHRNA6Q15825 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHRNA6Q15825 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CHRNA6Q15825 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHRNA6Q15825 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHRNA6Q15825 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHRNA6Q15825 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CHRNA6Q15825 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHRNA6Q15825 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHRNA6Q15825 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CHRNA6Q15825 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CHRNA6Q15825 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CHRNA6Q15825 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CHRNA6Q15825 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHRNA6Q15825 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHRNA6Q15825 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CHRNA6Q15825 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHRNA6Q15825 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHRNA6Q15825 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHRNA6Q15825 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHRNA6Q15825 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHRNA6Q15825 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CHRNA6Q15825 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CHRNA6Q15825 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHRNA6Q15825 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHRNA6Q15825 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CHRNA6Q15825 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CHRNA6Q15825 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms