Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
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SEC23BQ15437 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
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SEC23BQ15437 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
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SEC23BQ15437 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
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SEC23BQ15437 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
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SEC23BQ15437 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
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