Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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SYCP1Q15431 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
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SYCP1Q15431 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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SYCP1Q15431 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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SYCP1Q15431 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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SYCP1Q15431 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
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SYCP1Q15431 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
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SYCP1Q15431 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
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SYCP1Q15431 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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SYCP1Q15431 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
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