Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
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PTPRRQ15256 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
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PTPRRQ15256 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
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PTPRRQ15256 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
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PTPRRQ15256 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
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PTPRRQ15256 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
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PTPRRQ15256 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
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PTPRRQ15256 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPRRQ15256 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
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