Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
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