Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 RN7SL131P-201ENST00000579043 256 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 CDH12-208ENST00000522262 3028 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 SNORA38B-201ENST00000363524 131 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 RNA5SP429-201ENST00000363688 109 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 LDHAP5-201ENST00000394996 622 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 MRPS21P5-201ENST00000417885 231 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 SPATA20P1-201ENST00000423089 438 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 RPL36AP55-201ENST00000454114 305 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 RPS10P28-201ENST00000480396 498 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 MTERF4-220ENST00000495694 909 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 CARSP2-201ENST00000520688 277 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AC009852.1-201ENST00000564058 465 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 RN7SL689P-201ENST00000577215 297 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AC009779.8-202ENST00000607990 932 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AC116165.3-201ENST00000614524 400 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 MIR6736-201ENST00000616799 59 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AC061999.1-201ENST00000624454 177 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AP000812.1-201ENST00000378140 477 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 RN7SKP117-201ENST00000410175 264 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AL138733.2-201ENST00000431947 804 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 SNRPBP1-201ENST00000443634 282 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AP002833.2-201ENST00000531585 462 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 COPZ1-205ENST00000548753 778 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 COPZ1-218ENST00000553231 551 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 RN7SL426P-201ENST00000579106 295 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 CCL23-203ENST00000615050 624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AC103564.3-201ENST00000621194 220 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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