Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 RNU6-167P-201ENST00000384292 106 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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