Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AL355922.5-201ENST00000553534 351 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
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