Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AKAP6-213ENST00000557354 5259 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SCARF1Q14162 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms