Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
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COL9A3Q14050 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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