Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 NR1H5P-201ENST00000452683 1377 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 AL359634.1-201ENST00000429807 1179 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.09□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC2.09□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
SPTAN1Q13813 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
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