Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL3Q13618 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130 ms