Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.1 ms