Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
EIF4EBP1Q13541 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
EIF4EBP1Q13541 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
EIF4EBP1Q13541 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
EIF4EBP1Q13541 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
EIF4EBP1Q13541 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
EIF4EBP1Q13541 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
EIF4EBP1Q13541 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
EIF4EBP1Q13541 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
EIF4EBP1Q13541 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
EIF4EBP1Q13541 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
EIF4EBP1Q13541 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
EIF4EBP1Q13541 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
EIF4EBP1Q13541 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
EIF4EBP1Q13541 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
EIF4EBP1Q13541 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
EIF4EBP1Q13541 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
EIF4EBP1Q13541 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
EIF4EBP1Q13541 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.57□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC2.57□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC2.57□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC2.57□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC2.57□□□□□ -2
EIF4EBP1Q13541 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.9 ms