Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
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CBX3Q13185 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
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CBX3Q13185 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
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CBX3Q13185 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
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CBX3Q13185 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
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CBX3Q13185 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
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CBX3Q13185 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
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CBX3Q13185 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
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CBX3Q13185 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
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