Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AL121834.1-201ENST00000572284 509 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
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