Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.4 ms