Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
PITX3O75364 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PITX3O75364 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PITX3O75364 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PITX3O75364 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PITX3O75364 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PITX3O75364 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PITX3O75364 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PITX3O75364 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PITX3O75364 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PITX3O75364 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PITX3O75364 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PITX3O75364 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PITX3O75364 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PITX3O75364 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PITX3O75364 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PITX3O75364 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PITX3O75364 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PITX3O75364 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PITX3O75364 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PITX3O75364 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PITX3O75364 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PITX3O75364 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PITX3O75364 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PITX3O75364 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PITX3O75364 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PITX3O75364 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PITX3O75364 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PITX3O75364 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PITX3O75364 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PITX3O75364 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PITX3O75364 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PITX3O75364 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PITX3O75364 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PITX3O75364 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
PITX3O75364 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
PITX3O75364 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PITX3O75364 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
PITX3O75364 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PITX3O75364 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PITX3O75364 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PITX3O75364 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PITX3O75364 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
PITX3O75364 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
PITX3O75364 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PITX3O75364 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PITX3O75364 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
PITX3O75364 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
PITX3O75364 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PITX3O75364 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
PITX3O75364 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PITX3O75364 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PITX3O75364 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PITX3O75364 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PITX3O75364 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PITX3O75364 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PITX3O75364 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PITX3O75364 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PITX3O75364 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PITX3O75364 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PITX3O75364 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PITX3O75364 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PITX3O75364 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PITX3O75364 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PITX3O75364 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PITX3O75364 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PITX3O75364 UBE2V2P4-201ENST00000447495 259 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PITX3O75364 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PITX3O75364 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PITX3O75364 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PITX3O75364 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PITX3O75364 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PITX3O75364 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PITX3O75364 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PITX3O75364 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PITX3O75364 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PITX3O75364 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PITX3O75364 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PITX3O75364 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PITX3O75364 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PITX3O75364 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PITX3O75364 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PITX3O75364 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PITX3O75364 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PITX3O75364 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PITX3O75364 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PITX3O75364 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PITX3O75364 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PITX3O75364 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PITX3O75364 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
PITX3O75364 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PITX3O75364 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PITX3O75364 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
PITX3O75364 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PITX3O75364 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PITX3O75364 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PITX3O75364 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PITX3O75364 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PITX3O75364 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PITX3O75364 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.8 ms