Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ERVV-1B6SEH8 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ERVV-1B6SEH8 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
ERVV-1B6SEH8 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
ERVV-1B6SEH8 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
ERVV-1B6SEH8 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ERVV-1B6SEH8 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
ERVV-1B6SEH8 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
ERVV-1B6SEH8 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ERVV-1B6SEH8 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
ERVV-1B6SEH8 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
ERVV-1B6SEH8 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ERVV-1B6SEH8 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ERVV-1B6SEH8 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ERVV-1B6SEH8 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ERVV-1B6SEH8 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
ERVV-1B6SEH8 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ERVV-1B6SEH8 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ERVV-1B6SEH8 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
ERVV-1B6SEH8 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ERVV-1B6SEH8 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ERVV-1B6SEH8 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
ERVV-1B6SEH8 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ERVV-1B6SEH8 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ERVV-1B6SEH8 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ERVV-1B6SEH8 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ERVV-1B6SEH8 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
ERVV-1B6SEH8 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
ERVV-1B6SEH8 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
ERVV-1B6SEH8 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ERVV-1B6SEH8 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
ERVV-1B6SEH8 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
ERVV-1B6SEH8 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
ERVV-1B6SEH8 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
ERVV-1B6SEH8 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ERVV-1B6SEH8 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ERVV-1B6SEH8 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ERVV-1B6SEH8 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ERVV-1B6SEH8 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ERVV-1B6SEH8 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ERVV-1B6SEH8 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ERVV-1B6SEH8 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ERVV-1B6SEH8 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ERVV-1B6SEH8 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ERVV-1B6SEH8 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ERVV-1B6SEH8 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ERVV-1B6SEH8 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ERVV-1B6SEH8 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ERVV-1B6SEH8 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ERVV-1B6SEH8 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ERVV-1B6SEH8 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ERVV-1B6SEH8 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ERVV-1B6SEH8 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ERVV-1B6SEH8 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ERVV-1B6SEH8 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ERVV-1B6SEH8 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ERVV-1B6SEH8 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
ERVV-1B6SEH8 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
ERVV-1B6SEH8 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ERVV-1B6SEH8 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ERVV-1B6SEH8 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
ERVV-1B6SEH8 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
ERVV-1B6SEH8 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
ERVV-1B6SEH8 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ERVV-1B6SEH8 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
ERVV-1B6SEH8 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
ERVV-1B6SEH8 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ERVV-1B6SEH8 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ERVV-1B6SEH8 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ERVV-1B6SEH8 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ERVV-1B6SEH8 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
ERVV-1B6SEH8 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
ERVV-1B6SEH8 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ERVV-1B6SEH8 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ERVV-1B6SEH8 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ERVV-1B6SEH8 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ERVV-1B6SEH8 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
ERVV-1B6SEH8 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
ERVV-1B6SEH8 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
ERVV-1B6SEH8 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ERVV-1B6SEH8 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
ERVV-1B6SEH8 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ERVV-1B6SEH8 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ERVV-1B6SEH8 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ERVV-1B6SEH8 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ERVV-1B6SEH8 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
ERVV-1B6SEH8 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
ERVV-1B6SEH8 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
ERVV-1B6SEH8 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ERVV-1B6SEH8 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ERVV-1B6SEH8 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
ERVV-1B6SEH8 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ERVV-1B6SEH8 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
ERVV-1B6SEH8 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
ERVV-1B6SEH8 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
ERVV-1B6SEH8 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
ERVV-1B6SEH8 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ERVV-1B6SEH8 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms