Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
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