Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
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SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
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SH3BP1Q9Y3L3 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
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SH3BP1Q9Y3L3 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
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SH3BP1Q9Y3L3 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
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