Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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USP35Q9P2H5 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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USP35Q9P2H5 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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