Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY3

LIN37, Protein lin-37 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN37Q96GY3 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LIN37Q96GY3 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms