Protein–RNA interactions for Protein: Q92623

TTC9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9Q92623 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TTC9Q92623 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms